《与老战友聊科学知识》第13期人类细胞图谱项目

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<p class="ql-block">人类细胞图谱项目(Human Cell Atlas,简称HCA)综述</p> <p class="ql-block">一、项目背景与目标</p> <p class="ql-block">人类细胞图谱(Human Cell Atlas,简称HCA)这一宏伟计划于2016年正式启动,犹如人类基因组计划的续章,旨在绘制出涵盖人体所有细胞类型的综合参考地图。这一地图将成为理解与维护人类健康、探索疾病诊断、监测及治疗的基石。HCA不仅为生物医学界提供了可靠且标准化的研究资源,更为未来人工智能在生物学领域的应用奠定了早期的“基准”。其目标是绘制从胚胎发育到成人衰老的全部细胞类型,即描绘人体约37.2万亿个细胞的宏伟图谱,为人类健康探索开辟新天地。</p> <p class="ql-block">二、阶段性成果:人类细胞草图</p> <p class="ql-block">2024年11月,HCA联盟在《自然》及其一系列子刊中,以专题形式同时发布了40多篇同行评审论文,公布了首个HCA细胞草图的重要进展。这一草图详尽记录了约6200万个人类细胞的详细信息,涵盖了神经系统、肺、心脏、肠道以及免疫系统等18个生物网络。从传递大脑电信号的神经元,到参与肺部气体交换的肺泡上皮细胞;从心脏的心肌细胞,到承担肠道消化与吸收重任的肠上皮细胞;再到免疫系统中的白细胞,这些细胞的详细信息为我们揭示了人体内部世界的奥秘。</p> <p class="ql-block">三、关键发现</p> <p class="ql-block">在消化道细胞图谱方面,HCA成功绘制出从口腔到肛门的完整消化道细胞图谱,发现了一种此前未知的肠道细胞,推测其可能与炎症性肠病有关。同时,HCA首次高精度详细描绘了胎儿骨骼形成过程,发现参与胎儿骨骼构建的基因与诱发骨关节炎的基因高度重合,为相关疾病的研究提供了新的视角。</p> <p class="ql-block">四、意义和影响</p> <p class="ql-block">HCA的成果对疾病研究具有深远意义。它全方位助力剖析疾病的起源和发展机制,通过将健康细胞与病变细胞进行比对,发现细胞层面的细微差异,为研发特效药物提供关键线索。在疾病诊断方面,医生可以提前介入,在疾病萌芽状态通过检测细胞层面变化,精准识别潜在风险,实现个性化医疗。对于肿瘤治疗,HCA有望开发“细胞靶向疗法”,精准识别癌细胞标志物和信号通路,减少对正常细胞的损伤,攻克恶性肿瘤。在神经退行性疾病研究中,借助图谱对神经元细胞及其周边支持细胞的剖析,深入了解阿尔茨海默病、帕金森病等发病进程,开发创新药物。此外,HCA还助力再生医学发展,依据图谱精准识别具有再生潜能的细胞类型及其位置,通过激活或引导分化,实现受损组织器官的原位修复。</p> <p class="ql-block">五、技术与方法</p> <p class="ql-block">HCA的技术手段不断进步。单细胞测序技术从最初的转录组测序发展到全基因组、表观基因组和蛋白质组测序,从单一组学测序发展到多组学联合测序,从单个细胞测序发展到亚细胞测序,并且测序规模从几十个细胞扩展到数百万个细胞。多组学技术源于单组学方法,并在此基础上扩展了技术流程,包括细胞分离和收集(微流控、移液器吸取、流式细胞术等),以及复杂的标记策略(例如分裂池条形码)。空间转录组和空间多组学技术在过去25年中不断发展,具体描述了四类主要技术,并展示了其在发育生物学、神经科学、病理学和植物科学领域的应用历史。</p> <p class="ql-block">六、未来展望</p> <p class="ql-block">HCA计划现已进入数据整合阶段,HCA数据门户目前拥有从约9100名捐赠者收集的约6200万个细胞的数据。研究团队正在构建18个HCA生物网络图谱,包括神经系统、肺、心脏、肠道和免疫系统的细胞图谱。随着分子和空间分析方法以及人工智能和机器学习新算法的融合,细胞图谱的构建正在从数据收集发展到图谱整合,为未来的生物医学研究提供更强大的支持。</p> <p class="ql-block">七、全球合作与贡献</p> <p class="ql-block">HCA团队由来自100多个国家的3600多名研究人员组成,涉及来自大约1700个机构的科学家。这些研究人员记录和研究来自大约100个国家的参与者的数据。例如,华大作为人类细胞图谱计划的参与方之一,致力于围绕近年来新兴的单细胞测序技术,进行新一代单细胞组学技术与生信方法研发,绘制重要生命系统、健康和疾病人群的单细胞图谱,为全球生物医学研究贡献力量。</p> <p class="ql-block">结论</p> <p class="ql-block">人类细胞图谱项目(HCA)通过绘制人体细胞的详细图谱,为理解人类健康和疾病提供了新的视角和工具。其阶段性成果——人类细胞草图,已经展示了在疾病研究、诊断、治疗和再生医学等领域的巨大潜力。随着技术的不断进步和全球科学家的共同努力,HCA项目将继续推动生物医学研究的前沿发展,为人类健康带来更多的希望和突破。</p>