光头强爸爸突然到访狗熊岭，向来严厉古板的强爸却对光头强嘘寒问暖，而朝夕相处却未能缓和关系，反而导致了父子矛盾的爆发……在一次激烈的争吵中，光头强和两熊被“缩小机”意外缩小，毫不知情的强爸伤心离开，并无意间带走了“缩小机”。于是，光头强和两熊踏上了追赶强爸和机器的“微观世界”冒险之旅。与此同时，一名陌生国外女记者突然出现，并频频出没于大马哈鱼生活的河域附近，举止神秘，牵出了一系列神秘事件。 在过年时，光头强的父母打电话过来，叫光头强回家，光头强说自己过的很好，并会带点年货回家，可是自己只有够回家的钱，正想找李老板要工资时，却被解雇了，光头强收到了李老板送的T恤衫，想把它卖掉，可是过了一天都没有一个客人买，光头强就不断寻找工作，终于找到了护林员的工作，和动物们一起保护丛林，后来李老板派来了伐木机器人，没保护好丛林，结果又被解雇了，但获得了工资，当他买完年货准备回家时，又想起动物们和伐木机器人，拿出年货和伐木机器人斗争，获得了胜利，但是自己却没了年货，熊大熊二和动物们拿出蜂蜜和水果等给光头强当年货，最后和光头强依依不舍的道别，动物们大喊着：“光头强，再见。”他们就此告别，但来年光头强还会与动物们再见。 到新年了，森林里各个动物都忙碌了起来，装灯结彩过新年。光头强也要回家过年，但是发现从狗熊岭到老家团结屯的车票只有一等票，他买不起，而此时又是腊月二十九了，于是便向欠钱的李老板讨债。李老板却要光头强砍百年美人松回来。无计可施的光头强不得不去砍树，因为普通电锯无法砍，还特地造了超级伐木机去砍。但是在动物们齐心协力下使伐木机出了故障，不被控制，把光头强的房屋砍得面目全非。熊大熊二从光头强母亲的电话处得知光头强只是想回家，于是决定送他回家。在齐心协力之下，熊大熊二驾驶着由伐木机改装的汽车载他回家。结果吉吉和毛毛也偷上了车。它们在车上扔苹果核砸到一名警察头上，警察便要捉住它们，但失败了。此时光头强醒来以为它们要驱逐自己出森林，便逃跑随便上了一辆车，到达了火车站。熊大熊二也跟着到了。要捉住它们的警察到了车上发现没人。此时吉吉和毛毛偷了警察的摩托车也奔向火车站。<br>在火车站，光头强听见正好是去老家的车，便偷偷到了行李车厢准备进去，却被人当做小偷被揪住。在这千钧一发之时，熊大熊二出现了，让揪光头强的保安都去捉它们，光头强趁机上车。熊大熊二被捉住后，光头强无意听见保安要卖熊给研究院去做研究，思想斗争后下车去拯救它们。熊救到了，火车却开走了。此时熊大熊二用简易车头帮他上火车。结果光头强正要跳上火车时，因风大他被吹到林子里，正巧乘上吉吉毛毛驾驶的摩托车，而因吉吉的疏忽车撞上树，摩托车撞成两半，光头强那没有操纵盘的一半又行驶上了铁道，被熊大绳子牵住，结果绳子即将断裂之时熊二抓住了绳子，熊大熊二和光头强终于都上了火车，光头强也在进入隧道的一刹那拯救了熊大熊二。<br>大年三十晚上新年的钟声敲响时光头强和熊大熊二幸福地躺在一起，度过了美满的新年。大年初一早晨列车抵达团结屯，光头强发现熊大熊二早已在半路下车，却发现行李上有着它们画的画，想起它们对自己的帮助才回到的家，感动落泪，泪与画糊成一团，看不分明了。熊大熊二走得累时，恰逢吉吉毛毛的另半辆摩托车，动物们乘摩托车开始了向它们的老家森林的进发，可因为熊大熊二太重，摩托车非常慢。光头强到家时百感交集，高兴不已。 最新的考古发现证实，三万年前，白熊山曾有原始人类在此生活，他们还留下了丰富而神秘的岩画遗迹……一次偶然的意外，转行成为导游的光头强无意间与熊大，熊二从一个奇异的山洞穿越到了一个陌生的新世界。这里，竟然是史前石器时代！奇特复杂的地形地貌、凶猛的原始野兽……熊强面临着前所未有的险阻和困境，更糟糕的是，混乱中，熊大与熊二、光头强不幸失散。在陌生的原始森林中，熊大偶遇了一只调皮古怪的小狼女，小狼女以为熊大带路为条件，要求熊大为她寻找传说中的勇气果。喷着地热的脆弱地层、如同迷宫一般的钟乳石洞、吸血巨蚊盘踞的夜光植物森林……原始森林充满着未知和惊险。无奈之下，熊大只好与小狼女结伴，踏上了寻找小伙伴和勇气果的森林历险旅程。<br>熊大、熊二、光头强三人遇到被狼群驱逐的“胆小鬼“飞飞”。因为对原始人类的帮助，他们遭到头狼（独眼）的追杀。为了保护同伴，飞飞关键时刻终于找回自己的勇气，众人齐心打败头狼（独眼）度过危难，熊强三人也顺利回到现代